マグマ団とアクア団、両方の野望をくいとめろ！「エメラルド」の冒険の舞台は、「ルビー・サファイア」と同じホウエン地方。ミシロタウンに引っ越してきた主人公は、オダマキ博士から1匹のポケモンと「ポケモンずん」をもらって、冒険の旅に出るのだが……。「ルビー・サファイア」ではどちらか一方しか出てこなかったマグマ団とアクア団が、「エメラルド」では両方とも登場し、主人公の行く手をはばむ！はたして主人公は、両方の組織の野望をくいとめることができるだろうか！？対応ハード：ゲームボーイアドバンス 対応周辺機器：ワイヤレスアダプタ、ゲームボーイアドバンス専用通信ケーブル